Natsume Takashi possiede la capacitą di vedere gli spiriti fin da quando era un bambino. Ormai adolescente, eredita dalla sua defunta nonna, Reiko, un libro molto particolare: il Yuujinchou. Questo manoscritto contiene i nomi di tutti gli spiriti che Reiko ha sconfitto quand'era ancora un vita. La presenza del Yuujinchou provoca un cambiamento nel comportamento degli Youkai, i quali inizieranno a dare la caccia al povero Natsume. Durante una delle sue fughe il ragazzo si imbatterą in Madara, uno spirito avente le sembianze di un "gatto della fortuna". I due metteranno insieme le proprie forze per lanciarsi nella loro missione: liberare tutti gli Youkai il cui nome č riportato nel Yuujinchou.
